基于单细胞RNA测序的接触性皮炎免疫微环境特征分析

Abstract

本研究利用单细胞转录组测序技术解析接触性皮炎（allergic contact dermatitis，ACD）皮损的免疫微环境特征。从Gene Expression Omnibus（GEO）获取GSE267929数据集（9例ACD、12例健康对照，45,942个细胞），采用Seurat v5完成质控、降维聚类与细胞注释，并结合GSEA通路富集、转录因子预测、配受体共表达与CellChat通讯分析及复合基因评分刻画候选调控网络。结果显示：共注释14种细胞类型；以各样本内比例为单位、组间采用Wilcoxon秩和检验，ACD皮损中活化T细胞（5.77%→40.27%）、增殖T细胞与应激角质形成细胞比例显著增加，Th2细胞比例显著降低（39.00%→7.12%）（均P< 0.05）；IFN-γ/α反应、蛋白酶体及抗原加工呈递通路显著富集，巨噬细胞中提示NF-κB-STAT-IRF候选调控网络。配受体分析显示IL-1、TNF等轴在对照组更强、CD40LG–CD40两组接近，CXCL9–CXCR3为ACD组独有；复合评分筛选出CD40、CXCL9等候选核心基因。结论：ACD皮损以Th1型免疫活化、角质形成细胞应激及CD40等共刺激/抗原呈递分子上调为特征；上述结果均为转录本层面的计算线索，可为认识ACD免疫病理并筛选候选干预分子提供参考，尚不能据此确立因果机制或治疗靶点。